Quel logiciel comptable choisir en entreprise individuelle ?

Tableau comparatif des logiciels de comptabilité pour entreprise individuelle

*Tarifs mensuels constatés sur le marché en octobre 2026.

Quel logiciel de comptabilité choisir pour une entreprise individuelle ?

Tiime

Avec son interface simple d'utilisation, Tiime permet d'éditer et de personnaliser des devis et factures conformes, en illimité, dès son offre gratuite. Avec l'offre Business à 24,99 € par mois, il devient possible de synchroniser les comptes bancaires de l'entreprise et de gérer les notes de frais. Ce n'est cependant pas un logiciel de comptabilité d'engagement complet.

Pour qui ? Les micro-entrepreneurs et EI qui veulent un outil de facturation économique, à compléter par un comptable au régime réel.

Prix : de 0 € HT/mois (Free) à 24,99 € HT/mois (Business).

Swapn

Swapn est un service de comptabilité en ligne pensé pour les entreprises individuelles au régime réel qui veulent gagner en autonomie sans gérer seules la partie déclarative. Grâce à la synchronisation bancaire, vous catégorisez vos transactions, ce qui permet de calculer automatiquement la TVA, télé-déclarée directement à impots.gouv.fr.

Pour qui ? Les EI au régime réel qui veulent déléguer la partie déclarative à un tarif accessible.

Prix : dès 29 € HT/mois, sans engagement. L'application Tiime est offerte pendant 6 mois, puis facturée 17,99 € HT/mois, sans engagement.

L-Expert-Comptable.com

Pour les entrepreneurs individuels qui souhaitent combiner la simplicité de Tiime avec l'expertise d'un professionnel, L-Expert-Comptable.com propose un comptable dédié qui prend en charge la révision des comptes, les déclarations et la production de la déclaration de résultat ou de la liasse fiscale.

Pour qui ? Les entrepreneurs individuels au régime réel (BNC ou BIC) qui préfèrent confier leur comptabilité à un comptable dédié plutôt que de la gérer seuls.

Prix : de 39 € HT/mois (BNC sans TVA) à 109 € HT/mois pour les activités BIC complexes, sans engagement. L'application Tiime est offerte pendant 6 mois, puis facturée 17,99 € HT/mois, sans engagement.

Indy

Indy propose une solution complète, de 0 € à 71 € HT par mois selon l’offre. Dès l’offre Autonomie (22 € HT/mois), il produit et télétransmet la déclaration 2035 et la TVA. Il ne couvre en revanche que les EI en BNC ou à l’IS : les commerçants et artisans au BIC à l’impôt sur le revenu ne sont pas éligibles.

Pour qui ? Les professions libérales en EI (BNC) qui veulent une autonomie totale, tant que leur activité reste simple.

Prix : de 0 € à 71 € HT/mois selon l’offre (tarifs en paiement annuel).

Pennylane

Pennylane centralise facturation, trésorerie et comptabilité. Le tarif d'entrée reste accessible, mais la comptabilité d'engagement complète, la TVA en EDI et le bilan ne sont disponibles qu'à partir de l'offre Premium.

Pour qui ? Les entrepreneurs individuels en croissance qui veulent un outil complet en autonomie, en lien avec leur propre expert-comptable.

Prix : de 7 € HT/mois à 149 € HT/mois dès qu'un salarié est déclaré.

Sage

Sage 50 Compta (ex-Ciel Compta) est un logiciel installé ou en ligne, conçu pour des besoins de gestion plus avancés, avec une saisie des écritures simplifiée et un accès à la trésorerie prévisionnelle.

Pour qui ? Les entreprises individuelles au régime réel normal avec des besoins comptables plus complexes qu'une simple activité en micro ou au réel simplifié.

Prix : de 21 € HT/mois (Essentials) à 86 € HT/mois (Premium).

Comment choisir le meilleur logiciel comptable pour votre entreprise individuelle ?

Le choix d'un logiciel de comptabilité pour une entreprise individuelle dépend avant tout de votre régime fiscal (micro, réel simplifié, réel normal ou déclaration contrôlée) et de votre niveau d'autonomie souhaité. Il s'agit aussi de définir le budget que vous êtes prêt à allouer à ce poste, et le temps que vous souhaitez y consacrer.

Le logiciel choisi doit répondre à certains critères essentiels :

• l'enregistrement facilité des recettes et des dépenses
• la génération du registre des achats et, au réel, du livre-journal
• l'édition de la déclaration adaptée à votre régime (2042-C-PRO, 2031, 2035 ou 2033)
• la synchronisation bancaire
• la possibilité de déclarer la TVA en ligne si vous y êtes assujetti
• l'intégration directe des justificatifs
• des mises à jour régulières et une conformité à la réforme de la facturation électronique
• un service client réactif

L'objectif d'un bon logiciel de comptabilité pour une entreprise individuelle est de faire gagner du temps et de réduire les erreurs, à condition qu'il soit adapté à votre régime et correctement paramétré. Certains outils sont surtout pensés pour la facturation, d'autres couvrent une comptabilité complète : le choix dépend de vos obligations réelles, qui varient fortement entre une micro-entreprise et une EI au régime réel.

Les spécificités fiscales de l'entreprise individuelle et votre logiciel

L'EI au régime réel simplifié

Au-delà des seuils de la micro-entreprise, ou sur option, l'entreprise individuelle passe au régime réel. Elle doit alors tenir une comptabilité complète (livre-journal, grand livre) et produire une déclaration de résultat : 2031 pour les BIC, 2035 pour les BNC. Le logiciel doit gérer nativement la TVA si l'activité y est assujettie.

L'EI à la déclaration contrôlée ou au réel normal

Pour les activités BNC dépassant les seuils du régime simplifié, ou sur option pour le réel normal en BIC, les obligations se complexifient : comptabilité d'engagement complète, amortissements détaillés, annexes fiscales. C'est à ce niveau que l'accompagnement d'un comptable devient particulièrement pertinent.

Logiciel de comptabilité ou expert-comptable pour votre entreprise individuelle ?

Est-ce obligatoire d'avoir un comptable en entreprise individuelle ?

Non, aucune loi n'impose à un entrepreneur individuel de recourir à un expert-comptable. Un logiciel adapté permet de tenir sa comptabilité seul, notamment en EI. Au régime réel, la production d'une déclaration conforme, le calcul des amortissements et le respect des échéances fiscales demandent davantage de rigueur technique, ce qui rend l'accompagnement d'un professionnel fortement recommandé.

Combien coûte un expert-comptable pour une entreprise individuelle ?

Le coût varie généralement entre 40 € et 110 € HT par mois selon le régime fiscal et la complexité de l'activité. Chez L-Expert-Comptable.com, l'accompagnement débute à 39 € HT/mois et inclut :

• la tenue de comptabilité complète
• les déclarations de TVA le cas échéant
• la production de la déclaration de résultat (2031, 2035) ou de la liasse fiscale
• un comptable dédié
• l'accès au logiciel Tiime (6 mois offerts, puis 17,99 € HT/mois, sans engagement)

Les questions fréquentes sur le logiciel de comptabilité pour entreprise individuelle

Un logiciel de comptabilité suffit-il pour gérer une entreprise individuelle sans expert-comptable ?

En micro-entreprise, oui dans la plupart des cas : un logiciel comme Tiime permet de tenir le registre des recettes et des achats. Au régime réel, la production de la déclaration et le respect des règles fiscales rendent l'accompagnement d'un professionnel plus sûr.

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité gratuit pour une entreprise individuelle ?

Tiime dispose d'une offre gratuite qui permet de créer des devis et factures conformes en illimité, de suivre son chiffre d'affaires et d'être prêt pour la réforme de la facturation électronique.

Combien coûte un logiciel de comptabilité pour une entreprise individuelle ?

Sans salarié, un logiciel seul coûte de 0 € HT/mois pour la facturation de base à 86 € HT/mois pour les formules les plus complètes. Avec un comptable inclus, comptez de 29 € HT/mois (Swapn) à 109 € HT/mois (L-Expert-Comptable.com).

Quelle différence entre un logiciel de facturation et un logiciel de comptabilité pour mon entreprise individuelle ?

Un logiciel de facturation crée des factures mais ne tient pas de comptabilité complète. Un logiciel comme Tiime couvre la facturation et une pré-comptabilité, mais ne produit pas de déclaration de résultat : au régime réel, un outil de facturation seul ne suffit pas.

Micro-entreprise ou entreprise individuelle au réel : le logiciel change-t-il ?

Oui. En micro-entreprise, un logiciel de facturation simple suffit. Au régime réel, il faut un outil capable de gérer la TVA, le livre-journal et la déclaration 2031 ou 2035, voire l'accompagnement d'un comptable dédié.

Puis-je utiliser Excel pour la comptabilité de mon entreprise individuelle ?

Rien ne l'interdit en EI pour le livre des recettes. Au régime réel, c'est déconseillé : Excel ne génère pas de FEC conforme et n'assure pas la traçabilité exigée en cas de contrôle fiscal.

Quel logiciel de comptabilité gère la TVA pour une entreprise individuelle ?

Swapn intègre la télé-déclaration de TVA directement. Indy et Pennylane la gèrent également, mais réservent parfois certaines fonctions à leurs offres supérieures. Tiime ne gère pas la TVA en direct : elle est prise en charge en collaboration avec un expert-comptable.

Un logiciel peut-il remplacer un expert-comptable pour une entreprise individuelle ?

Un logiciel prend en charge les tâches automatisables : facturation, synchronisation bancaire, catégorisation. Un comptable reste indispensable pour sécuriser la déclaration de résultat et optimiser la fiscalité, notamment au régime réel.

Comment vérifier que mon logiciel comptable est conforme à la réglementation française ?

Trois points à vérifier : l'export du FEC doit être conforme, le logiciel doit attester de sa conformité anti-fraude TVA, et il doit être compatible avec la réforme de la facturation électronique (réception dès septembre 2026).

Sources et références

• Legifrance : Code de commerce, articles L123-12 à L123-24
• Legifrance : Code de commerce, article R123-174