Logiciels comptables pour infirmière libérale

L'article en bref

  • Tiime : logiciel de facturation et pré-comptabilité, avec une offre gratuite complète, adapté aux prestations annexes non exonérées de TVA.
  • Swapn : service de comptabilité en ligne dès 29 € HT/mois, sans engagement, avec l'assistance de nos comptables pour les infirmières en société ou en cabinet de groupe.
  • L-Expert-Comptable.com : comptable dédié qui connaît les spécificités CARPIMKO et l'exonération de TVA, à partir de 39 € HT/mois, sans engagement.
  • VEGA : logiciel métier agréé SESAM-Vitale, dès 45 € HT/mois, mais qui ne gère ni la TVA ni le bilan.
  • Agathe YOU : logiciel métier complet pensé pour les IDEL (facturation, tournées, comptabilité), à partir de 129 € HT/mois.
  • Indy : logiciel comptable largement recommandé pour les infirmiers libéraux, avec une offre gratuite.
Mis à jour le 2 août 2026
4 min

Sommaire

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Tableau comparatif des logiciels pour infirmière libérale

SolutionTypeTarif mensuel HTTélétransmission SESAM-VitaleTVA & bilanAccompagnement humainNombre d'avis
TiimeLogiciel de facturation et pré-comptabilité0 € à 24,99 €Non ❌Non géré, avec expert-comptableSupport client (tél, mail, chat) dès l'offre gratuite4,8/5 Google et Trustpilot (1 500+ avis)
SwapnService de comptabilité en ligneDès 29 €, sans engagementNon (comptabilité uniquement) ❌Géré, y compris cas d'exonération ✅Assistance de nos comptables (tél, visio, chat, e-mail), réponse sous 24h4,9/5 Google (800+ avis), 4,9/5 Trustpilot (400+ avis)
L-Expert-Comptable.comCabinet comptable en ligneDe 39 € à 69 € selon régime, sans engagementNon (comptabilité uniquement) ❌Géré par le comptable dédié ✅Comptable dédié (tél, visio, e-mail), réponse sous 24h4,8/5 Google (1 400+ avis), 4,6/5 Trustpilot (520+ avis)
VEGALogiciel métier de gestion de cabinetDès 45€Oui, agréé SESAM-Vitale ✅Non applicable ❌Hotline éditeur, pas de comptable4,2/5 Trustpilot (60+ avis)
Agathe YOULogiciel métier de gestion de cabinetDès 129 €Oui, agréé SESAM-Vitale ✅Non applicable ❌Support éditeur, pas de comptableAvis variables selon la plateforme
IndyLogiciel comptable tout-en-unDe 0 € à 59 € selon statutNon ❌Gérable, réservé à l'offre PremiumOption expert-comptable en supplément (+59 €/mois)4,8/5 Trustpilot (14 000+ avis)

*Tarifs mensuels constatés sur le marché en juillet 2026.

Zoom sur les solutions adaptées aux infirmières libérales

Une infirmière libérale conventionnée exerce l'essentiel de son activité au domicile de ses patients, avec des actes exonérés de TVA et facturés directement à l'Assurance Maladie via SESAM-Vitale. Ni Tiime, ni Swapn, ni L-Expert-Comptable.com ne couvrent cette télétransmission : c'est le rôle des logiciels métier comme VEGA ou Agathe YOU.

Tiime

Tiime permet d'éditer des factures conformes, en illimité, dès son offre gratuite. Pour une infirmière libérale, il est surtout utile pour facturer les rares prestations non couvertes par l'Assurance Maladie ou les remplacements ponctuels facturés hors cadre conventionné.

Avantages

Inconvénients

✅ Facturation illimitée dès l'offre gratuite❌ Ne gère pas la télétransmission SESAM-Vitale
✅ Application mobile pour les notes de frais et indemnités kilométriques❌ Ne produit pas de déclaration 2035 ni de bilan
✅ Transmission des justificatifs en temps réel à un expert-comptable❌ Ne remplace pas un logiciel métier agréé

Pour qui ? Les infirmières libérales qui ont besoin d'un complément de facturation ponctuel, en plus de leur logiciel métier et de leur comptable.

Prix : de 0 € HT/mois (Free) à 24,99 € HT/mois (Business).

Swapn

Swapn est un service de comptabilité en ligne pensé pour les infirmières en société ou en cabinet de groupe qui veulent déléguer la partie déclarative, y compris la gestion des rétrocessions entre titulaires et remplaçantes.

Avantages

Inconvénients

✅ Assistance de nos comptables incluse dès 29 € HT/mois, sans engagement❌ Micro-entreprise non éligible à l'accompagnement comptable
✅ Déclaration 2035 et gestion des indemnités kilométriques incluses❌ Fonctionnement en équipe, pas de comptable unique attitré
✅ Facturation illimitée via Tiime pour les prestations annexes❌ Ne remplace pas un logiciel métier pour la télétransmission SESAM-Vitale

Pour qui ? Les infirmières libérales en société ou en cabinet de groupe qui veulent déléguer leur comptabilité à un tarif accessible.

Prix : dès 29 € HT/mois, sans engagement. L'application Tiime Smart est offerte pendant 6 mois, puis facturée 17,99 € HT/mois, sans engagement.

L-Expert-Comptable.com

Un comptable dédié qui connaît les spécificités de la profession : exonération de TVA sur les actes, cotisation CARPIMKO, indemnités kilométriques significatives compte tenu des tournées à domicile, et rétrocessions en cas de remplacement.

Avantages

Inconvénients

✅ Comptable dédié qui maîtrise l'exonération de TVA et la CARPIMKO❌ Micro-entreprise non éligible à l'accompagnement comptable
✅ Déclaration 2035, bilan et conseils fiscaux inclus❌ Tarif plus élevé qu'un logiciel seul
✅ Application Tiime incluse pour la facturation des prestations annexes❌ Ne couvre pas la télétransmission SESAM-Vitale, distincte de la comptabilité

Pour qui ? Les infirmières libérales en cabinet individuel ou de groupe qui préfèrent confier la partie fiscale à un comptable dédié.

Prix : de 39 € HT/mois (BNC sans TVA) à 69 € HT/mois selon le régime, sans engagement. L'application Tiime Smart est offerte pendant 6 mois, puis facturée 17,99 € HT/mois, sans engagement.

VEGA

VEGA est un logiciel métier agréé SESAM-Vitale, utilisé par des infirmières, kinésithérapeutes, orthophonistes et orthoptistes, qui centralise la facturation, la télétransmission des feuilles de soins et la gestion de la patientèle.

Avantages

Inconvénients

✅ Agréé SESAM-Vitale, mises à jour réglementaires intégrées automatiquement❌ Ne gère ni la TVA, ni le bilan, ni aucune déclaration fiscale
✅ Tarif d'entrée accessible pour un logiciel métier agréé❌ Pas de spécificité propre aux tournées infirmières comme la gestion du BSI avancée
✅ Hotline dédiée en cas de difficulté❌ Nécessite un second outil pour la comptabilité

Pour qui ? Les infirmières libérales qui cherchent un logiciel métier économique et éprouvé pour la télétransmission, en complément d'un outil comptable séparé.

Prix : dès 41,50 € HT/mois, sans engagement.

Agathe YOU

Agathe YOU est un logiciel métier pensé spécifiquement pour les IDEL, qui va au-delà de la simple télétransmission : organisation des tournées, gestion de la patientèle, et module de comptabilité intégré.

Avantages

Inconvénients

✅ Organisation des tournées et gestion de la patientèle en plus de la télétransmission❌ Tarif nettement plus élevé que les autres logiciels métier (119 €/mois)
✅ Agréé SESAM-Vitale, conforme aux exigences FAMI❌ Le module comptabilité intégré ne remplace pas un expert-comptable
✅ Pensé uniquement pour les infirmières libérales❌ Investissement à amortir sur le FAMI et les gains de temps

Pour qui ? Les infirmières libérales, notamment en cabinet de groupe, qui veulent un outil tout-en-un couvrant à la fois la télétransmission et l'organisation quotidienne du cabinet.

Prix : à partir de 119 € HT/mois.

Indy

Indy est largement recommandé pour les infirmiers libéraux : il automatise la synchronisation bancaire, la déclaration 2035 et le suivi des cotisations URSSAF et CARPIMKO, avec une offre gratuite pour démarrer.

Avantages

Inconvénients

✅ Automatisation de la déclaration 2035 et des cotisations CARPIMKO❌ Bilan et fonctions avancées réservés à l'offre Premium
✅ Offre gratuite disponible pour démarrer❌ Pas d'expert-comptable inclus, option en supplément (+59 €/mois)
✅ Interface pensée pour les non-comptables❌ Ne gère pas la télétransmission SESAM-Vitale
 ❌ Contrairement à L-Expert-Comptable.com ou Swapn, Indy est un logiciel, pas un cabinet comptable. Il n'est pas habilité à vous fournir un conseil fiscal personnalisé

Pour qui ? Les infirmières libérales en exercice individuel qui veulent une large autonomie sur la partie comptable, en complément d'un logiciel métier pour la télétransmission.

Prix : de 0 € à 59 € HT/mois selon le statut.

Les spécificités comptables de l'infirmière libérale

Une exonération de TVA sur les actes de soins

Les actes infirmiers remboursés par l'Assurance Maladie sont exonérés de TVA au titre de l'article 261-4-1° du Code général des impôts, comme pour les autres professions médicales et paramédicales réglementées. La quasi-totalité de l'activité d'une IDEL conventionnée relève de cette exonération, ce qui simplifie sa situation fiscale par rapport à des professions qui cumulent actes exonérés et prestations imposables.

Les indemnités kilométriques, un poste central du revenu

Une infirmière libérale exerce majoritairement en tournée, au domicile de ses patients. Les indemnités kilométriques (IK), facturées en complément de chaque acte selon un barème conventionnel, représentent une part significative du chiffre d'affaires. Un mauvais suivi de ces IK, ou une confusion avec les frais de déplacement professionnels déductibles, peut fausser à la fois la déclaration de recettes et le calcul des charges réelles.

L'aide FAMI : une recette à ne pas oublier

Le Forfait d'Aide à la Modernisation et à l'Informatisation (FAMI), versé par l'Assurance Maladie, permet à une IDEL conventionnée de percevoir 490 € par an pour l'utilisation d'un logiciel métier conforme, jusqu'à 1 115 € avec les indicateurs complémentaires (exercice coordonné, équipements de télésanté). Cette aide, versée sous réserve d'une déclaration annuelle sur Amelipro, doit être intégrée dans le suivi comptable comme un produit à part entière.

Comptabilité de l'infirmière libérale

Logiciel seul ou cabinet comptable : quelle option ?

Le bon choix dépend surtout de la structure d'exercice :

Option

Profil & situation

Solution & tarif

Logiciel seulInfirmière libérale en cabinet individuel (activité conventionnée classique).Tiime (en complément du logiciel métier comme VEGA)
Assistance comptableCabinet de groupe ou remplacements réguliers (gestion des rétrocessions, indemnités kilométriques, aide FAMI).Swapn (assistance de nos comptables dès 29 € HT/mois, sans engagement)
Comptable dédiéCabinet de groupe ou remplacements réguliers (besoin d'une expertise dédiée aux spécificités de la profession).L-Expert-Comptable.com (comptable dédié connaissant ces spécificités, dès 39 € HT/mois, sans engagement)

Facturation électronique : ce qui s'applique réellement aux infirmières libérales

Les actes de soins facturés à l'Assurance Maladie via SESAM-Vitale restent hors du champ de la réforme de la facturation électronique : ce circuit de télétransmission, antérieur et spécifique au secteur de la santé, n'est pas concerné par les échéances de 2026 et 2027.

La réforme s'applique en revanche aux relations professionnelles classiques d'une infirmière libérale : réception des factures de ses fournisseurs (matériel médical, véhicule, assurance) dès le 1er septembre 2026, puis émission de ses propres factures dans ce format à partir du 1er septembre 2027 si son activité comporte des prestations hors cadre conventionné facturées à des professionnels.

Questions fréquentes

Une infirmière libérale facture-t-elle la TVA sur ses actes ?

Non, les actes de soins remboursés par l'Assurance Maladie sont exonérés de TVA au titre de l'article 261-4-1° du CGI, comme pour les autres professions médicales et paramédicales réglementées.

Qu'est-ce que le FAMI et comment le récupérer ?

Le FAMI est une aide annuelle de l'Assurance Maladie, de 490 € à 1 115 € selon les indicateurs validés, versée aux infirmières libérales conventionnées qui utilisent un logiciel métier conforme au cahier des charges SESAM-Vitale. Elle doit être déclarée chaque année sur Amelipro, généralement entre janvier et début mars.

Faut-il un logiciel métier en plus d'un logiciel de comptabilité ?

Oui, dans la quasi-totalité des cas. Le logiciel métier (VEGA, Agathe YOU ou équivalent) gère la télétransmission SESAM-Vitale, obligatoire pour être remboursé par l'Assurance Maladie. Le logiciel de comptabilité gère la déclaration 2035, les charges et les cotisations sociales. Aucun des deux ne remplace l'autre.

Comment sont comptabilisées les indemnités kilométriques d'une infirmière libérale ?

Les indemnités kilométriques facturées à chaque acte, selon le barème conventionnel, constituent une recette professionnelle à part entière et doivent être intégrées au chiffre d'affaires déclaré, distinctement des frais de déplacement réels engagés par l'infirmière.

Quel régime social pour une infirmière libérale ?

Une infirmière libérale conventionnée relève du régime PAMC (praticiens et auxiliaires médicaux conventionnés) pour la maladie, et cotise à la CARPIMKO pour sa retraite, comme les masseurs-kinésithérapeutes et plusieurs autres professions paramédicales.

Combien coûte un expert-comptable pour une infirmière libérale ?

Le coût varie généralement entre 29 € et 69 € HT par mois selon le régime fiscal et la structure d'exercice. Chez L-Expert-Comptable.com, l'accompagnement démarre à 39 € HT/mois pour les BNC sans TVA.

Sources & Références

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  • ChatGPT
  • Perplexity
  • Claude

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